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RNA的提取和cDNA合成原理和实验方法(3)

第三节 植物病毒RNA 提取

 

大多植物病毒RNA 为单链RNA ,并且其极性与mRNA 极性相同,植物病毒RNA 提取较为简单,一般使用酚氯仿即可获得满意结果。

 

一、材料

 

提纯TMV病毒液(10mg/ml)。

 

二、设备

 

冷冻台式离心机,低温真空干燥仪,电泳仪,电泳槽。

 

三、试剂

 

TE-饱和酚:氯仿(1:1),氯仿,3M NaAc(pH5.2),乙醇(100%和70%),TE缓冲液,无RNA 酶的双菌水。

 

四、操作步骤

 

1、取一eppendorf管加入提纯TMV(10mg/ml)400ml,再加入等体积酚/氯仿,盖紧管盖后用手充分振荡1分钟,4℃下12000g离心10分钟。

 

2、吸取水相于一新eppendorf管,再用酚/氯仿抽提,直至水相和有机相交界面无蛋白为止。

 

3、吸取水相于新eppendorf心管,加入等体积氯仿,用手倒置离心管数十秒,4℃下12000g离心10分钟。

 

4、取水相,加入1/10倍体积的3mol/L NaAc(pH5.2),2.5倍体积的冰冷乙醇,混匀,-20℃30分钟。

 

5、4℃下12000g离心15分钟,小心弃去上清液,用70%乙醇洗涤沉淀,4℃下12000g离心5分钟。

 

6、小心弃去上清液,沉淀真空干燥5分钟或空气干燥10分钟,并溶于无RNA 酶的双菌水或TE缓冲液中。

 

7、取10ml进行电泳分析,另10ml用于cDNA合成。

 

[注意] 1、整个操作应尽可能在低温下进行。

 

2、由于病毒RNA 镶嵌于外壳蛋白里面,因此要充分剥去病毒外壳蛋白,一般需要多次进行酚/氯仿的抽提。

来源:丁香通

 

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