动物生物安全实验室的管理分两条路径进行，一是行政管理路径，由单位授权的部门管理；二是兽医技术路径，是通过兽医巡检管理。

两条路径各负其责，又相互配合，覆盖生物安全所有环节。由于动物感染实验的活动越来越多，用于病原性研究的动物种类跨度也越来越大，远远超过经典“实验动物”的种类，比如蝙蝠、野鸟、 蜱虫和各种患病的源头动物，动物实验生物安全问题伴随而来，使得实验室管理和技术要求难度加大，有时甚至觉得无从管理。 动物生物安全实验室的管理中，往往发现管理责任和技术要求主体不十分清楚， 该文就有关问题进行了讨论并提出一些建议，供管理人员和使用人员参考。