CsCl法从培养细胞中提取RNA

      通过硫氰酸胍提取和氯化铯离心法制备 RNA,适于分离细胞质和细胞核难分开的细胞以及富含 RNase 的细胞中的 RNA。


试剂、试剂盒

      磷酸盐缓冲溶液   硫氰酸胍溶液   CsCl   TES 缓冲液   乙酸钠缓冲液   无水乙醇   经 DEFC 处理的水。


仪器、耗材

      离心机   注射器及20W针头


实验步骤

一 材料与设备

      1) 磷酸盐缓冲溶液 (PBS)

      2) 硫氰酸胍溶液:4mol/L 硫氰酸胍,0.lmmol/LTris-HClpH7.5,1%β-巯基乙醇

      3)CsCl5.7mol/:L(DEPC 处理)

      4)TES 缓冲液:0.1%SDS,10 mmol/LTris-ClpH7.4,lmmol/LEDTA

      5)3 mmol/L 乙酸钠缓冲液 (PH5.2,DEPC 处理)

      6) 无水乙醇

      7) 经 DEFC 处理的水

      8) 离心机

      9)6 ml 注射器及 20W 针头


二 操作方法

1. 单层培养细胞

     1) 室温下用 PBS 洗涤细胞,每平皿 5 ml 洗涤 2 次。

     2) 在不超过 105 个细胞中加人 3.5 ml 硫氰酸胍溶液,使之遍布整个平皿。用橡胶细胞刮于擦刮平皿,回收黏稠的细胞裂解液,用装有 20-G 针头的注射器往返抽吸裂解物,舍并在一起

2. 悬浮培养细胞

      1) 离心回收≤l08 个细胞,用相当于 1/2 原有体积的 PBS 重悬之,并再次离心回收细胞。

      2) 往离心管中加人 3.5 ml 硫氰酸胍溶液。

      3) 用装有 20-G 针头的 6 ml 注射器将黏稠的细胞裂解液往返抽吸 4 次,并将其移至一个干净的试管中。本步骤的重要性在于可对染色体 DNA 进行剪切,以降低溶液的黏度,

      4) 在经硅化井高压过的 13 mmX51 mm 的超速离心管中,加人 1.5 ml 5.7mol/LCsCl 并在 CsCl 层加人 3.5 ml 细胞裂解液,界面应保持清晰。1)〜4) 步的操作均在室温进行。

      5) 于 18℃,150000g 离心 12〜20 h(缓慢加速和减速)

      6) 用巴斯德吸管的管尖在液面上吸取上清,管子随液面的下降而下降。当吸至仅剩约 100 ul 时,小心倒置管子, 倒出剩余液体在界面处应有一白色的 DNA 带,必须仔细地完全移去此带,因为它含有染色体 DNA。

       7) 晾于沉淀约 5〜lOmin,然后以 360ul TES 溶液重溶沉淀,反复用吸管上下抽吸,如此在室温逬行 5〜l0 min,转移溶液于另一干净的微量离心管。

      8) 加人 40u 13 mol/L pH5.2 的乙酸钠缓冲液和 1 ml 无水乙醇,在干冰/乙醇中沉淀 30mim,离心 10〜15 min, 用 360 ul 水重溶沉淀并重复沉淀过程。

      9) 沉淀晾干 l0 min, 溶解于 20ul 水中,取 10ul 稀释至 lml,测 A260 和 A280. 最后,以水溶液或乙醇沉淀的形式在一 70℃ 储存 RNA。


注意事项

      1) 要用足够的时间去重溶沉淀,否则 RNA 的产量会有显著下降。

      2) 小 RNA 在 CsCl 中离心时不能有效地沉淀,因此不能用此方法制备 5SRNA 和 tRNA 等分子。

      3) 乙醇可以洗去沉淀中的氯化铯. 使沉淀易于溶解

 

此文转载:丁香通


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